Em projetos especiais de separação, a tecnologia de membrana para tratamento de água é usada principalmente para concentração de materiais, tratamento de águas residuais de corantes e separação de proteínas em produtos biofarmacêuticos. As tecnologias de membrana de nanofiltração e eletrodiálise desempenham um papel na separação seletiva nesses campos, como a nanofiltração para a separação de substâncias com diferenças de peso molecular e a eletrodiálise para lidar com a recuperação de ácidos e álcalis. A purificação downstream em produtos biofarmacêuticos requer ultrafiltração e microfiltração para remover vírus ou detritos celulares para garantir a pureza e segurança do produto.